使用方便、操作简单。使用方式与WinZip/WinRAR完全相同，用户直接在Windows资源管理器中进行操作，实现软件的所有功能。软件的界面风格和操作也与WinZip/WinRAR类似，无需学习即可使用

Windows加密大师提供10多种国际公认的安全加密算法供用户选择，而且Windows加密大师会自动根据用户输入的密钥长度来调整加密算法的强度，从56位～512位不等。这种设计大大增加了企图解密Windows加密大师加密文件的解密者的难度。

Windows加密大师软件中不存在任何后门，用户加密文件的安全性完全由用户自己设定的密钥来控制，软件作者或其他人都无法使用后门来解密用户的加密文件。为此，Windows加密大师在帮助文件中公开了Windows加密大师生成的加密文件的存储格式，来供用户检验。

Windows加密大师对加密后文件的图标进行非常友好的处理，在资源管理其中，加密文件显示为原图标再加上右下角一个透明的小锁，非常直观明确。
加密后的文件可以与正常的文件一样使用。加密后文件的文件名及文件图标均保持不变，使用时，无需先对它进行解密，Windows加密大师会自动提示用户输入正确的密码，验证后打开文件，使用过程与不加密前完全一样，用户仍然可以编辑、修改文件。使用后Windows加密大师自动把最新的文件内容加密保护。Windows加密大师可将多个文件或文件夹打包加密为EXE自解密文件，该文件可完全脱离Windows加密大师软件，只要运行自身即可解密。

Windows加密大师的所有功能均可对批量文件和文件夹进行处理，可对整个目录树下的所有文件（包括其中子目录下的所有文件，不管子目录有多少层）一次性地进行加密、解密、生成散列码或粉碎文件的功能。

在加密文件时支持压缩文件的功能，使Windows加密大师加密文件占用更小的磁盘空间。

Windows加密大师对快捷方式进行了特殊处理，使用户更方便，Windows加密大师对快捷方式文件的加/解密、散列、粉碎等操作，直接对快捷方式指向的文件进行处理。